MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7120 plasmid pCC7120alpha

Total Repeats: 6858

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003276	T	6	6	203	208	0 %	100 %	0 %	0 %	17233018
2	NC_003276	GACT	2	8	223	230	25 %	25 %	25 %	25 %	17233018
3	NC_003276	GCG	2	6	235	240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233018
4	NC_003276	G	6	6	364	369	0 %	0 %	100 %	0 %	17233018
5	NC_003276	ATA	2	6	414	419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233018
6	NC_003276	TGT	2	6	447	452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233018
7	NC_003276	CTT	2	6	467	472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233018
8	NC_003276	TGG	2	6	477	482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233018
9	NC_003276	AAG	2	6	1118	1123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233019
10	NC_003276	AAC	2	6	1180	1185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233019
11	NC_003276	TAA	2	6	1206	1211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233019
12	NC_003276	AAAAG	2	10	1252	1261	80 %	0 %	20 %	0 %	17233019
13	NC_003276	GCAA	2	8	1341	1348	50 %	0 %	25 %	25 %	17233019
14	NC_003276	TA	3	6	1382	1387	50 %	50 %	0 %	0 %	17233019
15	NC_003276	CGT	2	6	1417	1422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233019
16	NC_003276	CCT	2	6	1470	1475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17233019
17	NC_003276	TC	3	6	1562	1567	0 %	50 %	0 %	50 %	17233019
18	NC_003276	A	6	6	1623	1628	100 %	0 %	0 %	0 %	17233019
19	NC_003276	TC	3	6	1633	1638	0 %	50 %	0 %	50 %	17233019
20	NC_003276	TCC	2	6	1651	1656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17233019
21	NC_003276	GCG	2	6	1698	1703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233019
22	NC_003276	AGA	2	6	1738	1743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233020
23	NC_003276	CT	3	6	1747	1752	0 %	50 %	0 %	50 %	17233020
24	NC_003276	TAG	2	6	1898	1903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233020
25	NC_003276	GA	3	6	1941	1946	50 %	0 %	50 %	0 %	17233020
26	NC_003276	ACG	2	6	1974	1979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233020
27	NC_003276	TGA	2	6	1981	1986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233020
28	NC_003276	ATT	2	6	2019	2024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233020
29	NC_003276	GGT	2	6	2082	2087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233020
30	NC_003276	TTG	2	6	2136	2141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233020
31	NC_003276	TTTG	2	8	2171	2178	0 %	75 %	25 %	0 %	17233020
32	NC_003276	CAG	2	6	2183	2188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233020
33	NC_003276	TTG	2	6	2206	2211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233020
34	NC_003276	GGT	3	9	2320	2328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233020
35	NC_003276	CTT	2	6	2335	2340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233020
36	NC_003276	T	6	6	2339	2344	0 %	100 %	0 %	0 %	17233020
37	NC_003276	CAT	2	6	2423	2428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233020
38	NC_003276	AAT	2	6	2456	2461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233020
39	NC_003276	AAT	2	6	2466	2471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233020
40	NC_003276	T	10	10	2532	2541	0 %	100 %	0 %	0 %	17233021
41	NC_003276	T	6	6	2549	2554	0 %	100 %	0 %	0 %	17233021
42	NC_003276	AT	3	6	2572	2577	50 %	50 %	0 %	0 %	17233021
43	NC_003276	CTT	2	6	2589	2594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233021
44	NC_003276	GGTAAT	2	12	2598	2609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233021
45	NC_003276	ATTG	2	8	2660	2667	25 %	50 %	25 %	0 %	17233021
46	NC_003276	AAC	2	6	2680	2685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233021
47	NC_003276	TAA	3	9	2722	2730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233021
48	NC_003276	CTA	2	6	2733	2738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233021
49	NC_003276	TGA	2	6	2752	2757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233021
50	NC_003276	TAA	2	6	2758	2763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233021
51	NC_003276	ATA	2	6	2811	2816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233021
52	NC_003276	AAAG	2	8	2915	2922	75 %	0 %	25 %	0 %	17233021
53	NC_003276	GT	3	6	2947	2952	0 %	50 %	50 %	0 %	17233021
54	NC_003276	CGTT	2	8	2956	2963	0 %	50 %	25 %	25 %	17233021
55	NC_003276	GTAT	2	8	2996	3003	25 %	50 %	25 %	0 %	17233021
56	NC_003276	TA	3	6	3043	3048	50 %	50 %	0 %	0 %	17233021
57	NC_003276	CCAAA	2	10	3060	3069	60 %	0 %	0 %	40 %	17233021
58	NC_003276	CTT	2	6	3096	3101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233021
59	NC_003276	T	6	6	3118	3123	0 %	100 %	0 %	0 %	17233021
60	NC_003276	CTA	2	6	3174	3179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233021
61	NC_003276	ATT	2	6	3208	3213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233021
62	NC_003276	ATTC	2	8	3216	3223	25 %	50 %	0 %	25 %	17233021
63	NC_003276	AGCA	2	8	3510	3517	50 %	0 %	25 %	25 %	17233022
64	NC_003276	TTG	2	6	3561	3566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233022
65	NC_003276	TTG	2	6	3729	3734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233022
66	NC_003276	GAG	2	6	3742	3747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17233022
67	NC_003276	TCAG	2	8	3856	3863	25 %	25 %	25 %	25 %	17233023
68	NC_003276	ATCTGT	2	12	3898	3909	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	17233023
69	NC_003276	ATAC	2	8	3955	3962	50 %	25 %	0 %	25 %	17233023
70	NC_003276	GA	3	6	3991	3996	50 %	0 %	50 %	0 %	17233023
71	NC_003276	AAG	2	6	4023	4028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233023
72	NC_003276	GAA	2	6	4076	4081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233023
73	NC_003276	AAAC	2	8	4108	4115	75 %	0 %	0 %	25 %	17233023
74	NC_003276	TTA	2	6	4365	4370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233024
75	NC_003276	CTG	2	6	4430	4435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233024
76	NC_003276	CGA	2	6	4449	4454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233024
77	NC_003276	GCT	2	6	4533	4538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233024
78	NC_003276	ATCA	2	8	4568	4575	50 %	25 %	0 %	25 %	17233024
79	NC_003276	CAA	2	6	4591	4596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233024
80	NC_003276	TAT	2	6	4597	4602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233024
81	NC_003276	TTG	2	6	4624	4629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233024
82	NC_003276	TCT	2	6	4641	4646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233024
83	NC_003276	TAG	2	6	4662	4667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233024
84	NC_003276	T	6	6	4676	4681	0 %	100 %	0 %	0 %	17233024
85	NC_003276	T	6	6	4907	4912	0 %	100 %	0 %	0 %	17233024
86	NC_003276	CTT	2	6	4918	4923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233024
87	NC_003276	GAAT	2	8	4935	4942	50 %	25 %	25 %	0 %	17233024
88	NC_003276	CTT	2	6	4964	4969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233024
89	NC_003276	ACAA	2	8	5033	5040	75 %	0 %	0 %	25 %	17233024
90	NC_003276	ATCT	2	8	5050	5057	25 %	50 %	0 %	25 %	17233024
91	NC_003276	GAT	2	6	5260	5265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233025
92	NC_003276	AAGG	2	8	5276	5283	50 %	0 %	50 %	0 %	17233025
93	NC_003276	TGT	2	6	5370	5375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233025
94	NC_003276	ATT	2	6	5385	5390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233025
95	NC_003276	ATC	2	6	5459	5464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233025
96	NC_003276	AAT	2	6	5491	5496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233025
97	NC_003276	ATC	2	6	5508	5513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233025
98	NC_003276	TTG	2	6	5591	5596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233025
99	NC_003276	TGG	2	6	5604	5609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233025
100	NC_003276	AT	3	6	5634	5639	50 %	50 %	0 %	0 %	17233025
101	NC_003276	TCAC	2	8	5653	5660	25 %	25 %	0 %	50 %	17233025
102	NC_003276	T	6	6	5822	5827	0 %	100 %	0 %	0 %	17233026
103	NC_003276	ATT	2	6	5844	5849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233026
104	NC_003276	GAA	2	6	5856	5861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233026
105	NC_003276	CTG	2	6	5914	5919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233026
106	NC_003276	T	7	7	5930	5936	0 %	100 %	0 %	0 %	17233026
107	NC_003276	ATT	2	6	5966	5971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233026
108	NC_003276	AAC	2	6	6046	6051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233026
109	NC_003276	CTT	2	6	6070	6075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233026
110	NC_003276	TAA	2	6	6121	6126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233026
111	NC_003276	GAG	2	6	6142	6147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17233026
112	NC_003276	CAA	2	6	6157	6162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233026
113	NC_003276	TAT	2	6	6176	6181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233026
114	NC_003276	AAT	2	6	6212	6217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233026
115	NC_003276	TAA	2	6	6323	6328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233026
116	NC_003276	TCTT	2	8	6335	6342	0 %	75 %	0 %	25 %	17233026
117	NC_003276	AACT	2	8	6358	6365	50 %	25 %	0 %	25 %	17233026
118	NC_003276	T	6	6	6391	6396	0 %	100 %	0 %	0 %	17233026
119	NC_003276	TGC	3	9	6464	6472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233026
120	NC_003276	TGT	2	6	6486	6491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233026
121	NC_003276	TTG	2	6	6500	6505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233026
122	NC_003276	TGT	4	12	6543	6554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233026
123	NC_003276	CTT	2	6	6571	6576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233026
124	NC_003276	TATC	2	8	6621	6628	25 %	50 %	0 %	25 %	17233026
125	NC_003276	CTTG	2	8	6633	6640	0 %	50 %	25 %	25 %	17233026
126	NC_003276	AAG	2	6	6652	6657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233026
127	NC_003276	T	6	6	6706	6711	0 %	100 %	0 %	0 %	17233026
128	NC_003276	AGA	2	6	6764	6769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233026
129	NC_003276	ATTCA	2	10	6806	6815	40 %	40 %	0 %	20 %	17233026
130	NC_003276	CCG	2	6	6820	6825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233026
131	NC_003276	ATT	2	6	6861	6866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233026
132	NC_003276	AGTT	2	8	6902	6909	25 %	50 %	25 %	0 %	17233026
133	NC_003276	TTG	2	6	6920	6925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233026
134	NC_003276	T	6	6	6946	6951	0 %	100 %	0 %	0 %	17233026
135	NC_003276	ATC	2	6	6965	6970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233026
136	NC_003276	AAT	2	6	6983	6988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233026
137	NC_003276	GCT	2	6	7050	7055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233026
138	NC_003276	A	7	7	7136	7142	100 %	0 %	0 %	0 %	17233026
139	NC_003276	C	6	6	7173	7178	0 %	0 %	0 %	100 %	17233026
140	NC_003276	TCA	2	6	7212	7217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233026
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142	NC_003276	TCA	2	6	7249	7254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233026
143	NC_003276	AAT	2	6	7496	7501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233027
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256	NC_003276	T	7	7	14962	14968	0 %	100 %	0 %	0 %	17233035
257	NC_003276	AAC	2	6	15071	15076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233035
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269	NC_003276	GTT	2	6	15449	15454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233035
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271	NC_003276	ATA	2	6	15482	15487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233035
272	NC_003276	A	6	6	15523	15528	100 %	0 %	0 %	0 %	17233035
273	NC_003276	A	7	7	15553	15559	100 %	0 %	0 %	0 %	17233035
274	NC_003276	A	6	6	15579	15584	100 %	0 %	0 %	0 %	17233035
275	NC_003276	TAT	2	6	15699	15704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233036
276	NC_003276	TCA	2	6	15707	15712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233036
277	NC_003276	TCT	2	6	15745	15750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233036
278	NC_003276	AT	3	6	15769	15774	50 %	50 %	0 %	0 %	17233036
279	NC_003276	TGA	2	6	15860	15865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233036
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281	NC_003276	GAA	2	6	15893	15898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233036
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283	NC_003276	TA	4	8	15950	15957	50 %	50 %	0 %	0 %	17233036
284	NC_003276	AAG	2	6	16021	16026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233036
285	NC_003276	GTTT	2	8	16073	16080	0 %	75 %	25 %	0 %	17233036
286	NC_003276	TGA	2	6	16085	16090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233036
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289	NC_003276	GAA	2	6	16132	16137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233036
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292	NC_003276	TTC	2	6	16297	16302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233037
293	NC_003276	AT	5	10	16353	16362	50 %	50 %	0 %	0 %	17233037
294	NC_003276	T	6	6	16417	16422	0 %	100 %	0 %	0 %	17233037
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301	NC_003276	TGT	2	6	16577	16582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233037
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303	NC_003276	GTT	2	6	16701	16706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233037
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382	NC_003276	ATA	2	6	22215	22220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233042
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385	NC_003276	TC	3	6	22355	22360	0 %	50 %	0 %	50 %	17233042
386	NC_003276	ATTTA	2	10	22374	22383	40 %	60 %	0 %	0 %	17233042
387	NC_003276	ATCC	2	8	22544	22551	25 %	25 %	0 %	50 %	17233042
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389	NC_003276	TAA	2	6	22652	22657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233042
390	NC_003276	AGGT	2	8	22686	22693	25 %	25 %	50 %	0 %	17233042
391	NC_003276	ATTA	2	8	22698	22705	50 %	50 %	0 %	0 %	17233042
392	NC_003276	CAA	2	6	22712	22717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233042
393	NC_003276	CCT	2	6	22733	22738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17233042
394	NC_003276	AGATAA	2	12	22754	22765	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	17233042
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396	NC_003276	TGAT	2	8	22827	22834	25 %	50 %	25 %	0 %	17233042
397	NC_003276	AATATC	2	12	22912	22923	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	17233042
398	NC_003276	AAT	2	6	22931	22936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233042
399	NC_003276	TC	3	6	22971	22976	0 %	50 %	0 %	50 %	17233042
400	NC_003276	ATG	2	6	23041	23046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233042
401	NC_003276	TCT	2	6	23074	23079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233042
402	NC_003276	TAA	2	6	23090	23095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233042
403	NC_003276	CTT	2	6	23120	23125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233042
404	NC_003276	CAT	2	6	23162	23167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233042
405	NC_003276	ACT	2	6	23169	23174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233042
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432	NC_003276	CTT	2	6	24359	24364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233042
433	NC_003276	CATCC	2	10	24425	24434	20 %	20 %	0 %	60 %	17233042
434	NC_003276	ATTTAT	2	12	24455	24466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233042
435	NC_003276	AACAT	2	10	24483	24492	60 %	20 %	0 %	20 %	17233042
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500	NC_003276	CCGCG	2	10	28741	28750	0 %	0 %	40 %	60 %	17233046

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